张献忠带兵向陕西出发了。可是，军队的粮食供应出了问题。在张献忠的连续屠杀之下，四川哪里还有人生产？哪里还能产出粮食呢？四处都没有粮食，抢也抢不到，哪有粮食供应军队？
张献忠现在觉得军队成了他的累赘。他觉得只需要老部下三千人就足够了，继续进行他擅长的游击战，粮食容易抢，逃起来又方便。有三千骑兵纵横天下，你即使有千军万马又能奈我何？
走到顺庆，也就是今天的南充，张献忠决定屠杀自己的士兵。和丞相汪兆龄商量后，他决定先杀掉三类士兵：首当其冲的是四川籍士兵，这些人表面归附，内心不忠，有机会就逃跑；其次是明朝投降的士兵和收编的其他流寇，这些人也不忠心；其三是出生其他省份但不是在陕西起事时入伍的士兵，这些人忠诚度不够。也就是说，除了陕西人和早期跟随他的非陕西人，其他人一概屠杀。
张献忠狡诈多智，为了能够顺利屠杀成功，“先谎称要从士兵中挑出精干者，成立水师营。因此命令部队在张献忠等军官面前列队而过”，进行挑选。“先在江边建造了一个木栅城，挑出来的数万军人都关进城内，开杀之时，先用枪炮向内轰攻，死伤大半，然后方挥兵入内砍杀”，共杀了士兵二十多万人。
据《蜀难叙略》：张献忠“初杀蜀兵，蜀兵尽，次杀楚兵，楚兵尽，后杀同起事之秦兵”。两个多月，斩杀过半。张献忠还责其下属杀人不力，骂曰：老子只需劲旅三千，便可横行天下，要这么多人做甚！
在杀过自己士兵以后，张献忠把屠刀指向军中妇女。“各营所有妇女，齐集一处，由兵围绕，献忠另选兵人一队为刀斧手。号令一声，乱砍乱杀，叫冤哭惨之声，展动天地。妇女尸身堆积如山，血流成河。”
有史料记载，由于缺乏军粮，张军曾经把这些死亡者的尸体“剐之割之，制成腌肉，以充军粮”。
至于文官，早就被杀得差不多了，开朝时的一千多人，目前只剩下二十五名。士兵人数大概剩下三分之一，约十万人。
随后，张献忠率部向陕西启程，行至西充凤凰山，遭遇清兵。他随即“骑马出营，未穿盔甲，……，至一小岗上，正探看之际，突然一箭飞来，正中献忠肩下，由左旁射入，直透其心，顿时满地鲜血长流，献忠在血中乱滚，痛极而亡”。一代魔王结束了他的生命！其时，张献忠四十一岁。
张献忠在四川建立大西政权三年，使物力丰饶的天府之国，变成人烟俱灭、莽林丛生、狼奔豕突之地。张献忠在四川的统治没有给任何一个阶层带来好处，他身上彰显出来的人性之恶，是使其在四川无法立足，以及使得天府之国变得更加残破不堪的重要原因。当一个丧失理性的人居于权力之巅时，他所能展示出的，只是无比巨大的破坏性。